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Le programme est né de la volonté d'un groupe de chercheurs de l'ORSTOM, ayant par leur expérience compris la limite des études monodisciplinaires et désirant y remédier par une approche pluridisciplinaire. Sans abandonner leur spécialité, par une démarche librement acceptée de tous les participants, ils ont ainsi créé un programme de recherche interdisciplinaire.
A coté du Ministère de la Santé de Madagascar, l'ORSTOM et l'Institut Pasteur de Madagascar ont joué le jeu de la complémentarité.
C'est ainsi qu'ont été mis en place des groupes de refléxion tripartite (Ministère de la Santé, ORSTOM, IPM) sur la peste, le paludisme et les schistosomoses.
Basé sur le principe de la complémentarité des compétences, la constitution de ces groupes permet d'éviter la redondance des sujets de recherches, la concurrence négative entre les équipes et le gaspillage des moyens.